Bom tarde,
Nós estivemos a fazer alguns testes e verificamos o seguinte:
O erro que nos apresenta no seu Post não ocorre com todos os ficheiros flash, suponho que deve estar relacionado com a construção do ficheiro.
De qualquer forma, a área do Logo como está definida, não processa ficheiros flash. Para ultrapassar esta situação seria necessário proceder a alterações quer a nível de skins quer a nível dos ficheiros ascx. Como deve entender, esta solução não será a mais indicada pois traria problemas a outros sites.
Outra forma de resolver o seu problema seria optar por uma Skin que suportasse os banners, os skins MinimalExtropy - Index e a Minimal Extropy - Index full não permitem, e através dos banners utilizar os ficheiros flash.
Continuação de bom trabalho.